サイロンは自爆テロの報復として、事件に関わったと思われる人類を次々と逮捕・拘留していく。ローラ・ロズリンの説得にも関わらず、反乱組織のソール・タイ元大佐は自爆テロをやめる気配を見せない。サイロンは、ついに拘留した者たちの処刑を決定する。一…

サイロンに全面降伏した人類だが、ニュー・カプリカでは旧ギャラクティカの面々を中心に、反乱組織が活動を開始していた。また、軌道上空から撤退したギャラクティカも、戦うに備えて訓練を続けていた。ラプターを経由した地上とギャラクティカの連絡にも成…

ギャラクティカの応援部隊と反乱組織の連携により、処刑されようとしていた人々の救出に成功。彼らは、計画通りサイロンから宇宙船の発射キーを取り戻す作戦を実行に移す。そのために潜入したシャロンは、サイロンから彼女の娘であるヘラが生きていると告げ…